کمیته سیستم‌سازی با هدف طراحی، بهینه‌سازی و یکپارچه‌سازی فرآیندها و ساختارهای سازمانی فعالیت می‌کند. این کمیته با ریاست دکتر الهام شیرازی، تمرکز خود را بر ایجاد نظام‌های کارآمد، استانداردسازی رویه‌ها و افزایش بهره‌وری سازمانی قرار داده و با توسعه زیرساخت‌های سیستمی، زمینه‌ساز نظم، شفافیت و بهبود مستمر در عملکرد مجموعه می‌باشد.